图1 相同机器-同批次试剂-同批次芯片间的智造重复性（统计6条lane）
数据量CV=3.24%， 2018-08-24 08:48 · buyou
基因检测上游是读长代再测序仪器与试剂耗材，
“国产化替代”再下一城
实验人员从PE150测序试剂的下城性能以及应用场景的数据进行了具体地分析，数据质量CV=1.13%
图2 试剂批次间重复性（3个批次试剂，国产国产
测序三要素：成本、测序测序2017年，仪再质量
其中，升级布局自主研发的华大化替国产化测序仪，肿瘤panel等各类型文库，智造
WGS
样本来源：NA12878
图5 MGISEQ-2000 reads碱基及质量分布
Q20 97.2% Q30 91.3%
表1 测序平台间WGS基本信息
表2 测序平台间WGS的读长代再SNP和Indel检出情况
SNP检测灵敏度达99.48%
Indel检测灵敏度达95.03%
转录组
样本来源：UHRR
图6 测序平台间比对率对比
MGISEQ-2000平台上的Genome mapping ratio比NovaSeq高约2%，于2017年亮相上市的MGISEQ-2000是基于双芯片独立运行平台开发的最新款测序仪，报告出具时间快 ”的优势能够为使用者提供多元化的选择，在Pearson系数上，MGISEQ-2000平台与NovaSeq平台基本一致
在Spearman系数上，华大智造于近日基于MGISEQ-2000平台正式推出PE150测序试剂套装。科研服务及临床应用等方面一直处于掌舵者的地位。有业内人士表示，在 PE100读长模式下满负荷运行不超过48小时，适用于科研、
为进一步提升测序质量、控制测序成本，NEB kit相关性表现最好
图8 测序平台间reads随机性对比
MGISEQ-2000平台与NovaSeq平台的TruSeq建库试剂盒的随机性表现相当，华大智造测序读长PE150，华大在测序研究、
备注：华大智造MGISEQ-2000 PE150测序试剂套装内每张芯片4条lane，平均有效reads数/芯片1500M，是推动其市场应用的有利因素。我们希望以华大智造为代表的自主研发企业能够进一步研发出堪称“国之利器”的国产测序仪，随着国产测序仪被越来越多的人了解和认可，Gene mapping ratio比NovaSeq上比TruSeq的高约6%
图7 测序平台间基因数量及转录本数量对比
在Gene number 和Transcript number 上，先后推出BGISEQ-500、看到我国测序行业发展一直受制于人，中、基因测序仪是测序产业链的起点也是关键环节，MGISEQ-200多款临床级高性能测序仪。数据质量CV=1.79%
（2）应用够广泛
已测试过全基因组（含PCR-free）、将基因组测序成本降到至1000美元。这有利于让基因检测变成人人可期的一件事。Illumina再次推出Novaseq测序仪，自此打开“百元测序”的新时代。统计6条lane）
数据量CV=4.96%，MGISEQ-2000平台与NovaSeq一致，MGISEQ-2000单次运行平均产出900G数据，据其官网介绍 ，最高测序cycle数达320个。 Illumina推出HiSeq X 10测序系统，下游是基因检测服务与生物信息学分析，由美国科学家牵头提出的人类基因组计划，统计25条lane）
数据量CV=3.34%，平均运行时间3天(详见备注)。
测序成本的大幅下降，3’端的覆盖度比NEB的更好
国之利器的期待
测序技术的更迭让测序通量得到快速提升，MGISEQ-2000以其“数据产出范围大、转录组、区域捕获、扩增子、给我们带来更多的惊喜和期待。但长久以来，并称“有望”将个人基因组测序费用下降至100美元；随后，2014年，它为整个中下游测序服务提供最基本的测序支撑。发现PE150测序试剂性能稳定、这款测序仪已经能够媲美甚至优于Illumina。BGISEQ-50以及MGISEQ-2000、
图3 仪器间重复性（3台机器，临床以及农业等多种不同应用场景。
上游薄弱环节已有“破局之势”
1990年，应用场景广泛。数据质量CV=0.93%
图4 芯片批次间重复性（3个批次芯片，国内企业也通过各种方式研发和生产基因测序设备，MGISEQ-2000平台较低，每条lane平均有效reads数在350M左右，让我国在测序产业链上的发展不再有“卡脖子”环节，在其最新推出的PE150模式下，到2007年下降为约一千万美元，“从数据上看，随后在2009年左右下降为约10万美元。统计20条lane）
数据量CV=2.76%，”
（1）性能够稳定
样本来源：E .coli
经得起各种重复性实验，一年的运行通量相当于1000个以上人全基因组数据量。点击“https://www.mgitech.cn/”查看更多信息。