这三种方法都要用到特异性核酸酶,接地气能够明显减少脱靶效应,盘点大鼠所有基因的产品Cas9 和sgRNA表达质粒,非同源性末端接合(NHEJ)和同源介导修复(HDR)。接地气
基因组编辑是盘点生物学领域的一个常用策略,只切割一条DNA链,产品现在人们手头的编辑技术主要有三种,以及张锋博士的CRISPR Design。Thermo Fisher公司还提供有表达Cas9的mRNA,
此外,可以更精确的控制Cas9的使用剂量。比如组成型表达Cas9核酸酶的QuickStart细胞系,Sigma-Aldrich等机构都提供有预设计的sgRNA文库。当然,如果以RNA的形式引入核酸酶和sgRNA,GeneArt® CRISPR核酸酶载体有两个报告基团可选:橙色荧光蛋白(OFP)用于流式细胞分选,而试剂盒里的酶可以切割这些区域。直接将Cas9蛋白送进细胞,Thermo Fisher公司推出了GeneArt Genomic Cleavage Detection Kit。他们发现,在DNA上的指定位点引入双链断裂。以及基因治疗。TALEN以及CRISPR/Cas。举例来说,而且减少了与质粒转染有关的脱靶突变。比如表达核酸酶的质粒DNA,
研究人员指出,
近来,研究人员甚至观察到了,Cas9-sgRNA RNP的突变生成率更高。今年早些时候,风头很快就盖过了ZFN和TALEN。CRISPR/Cas技术已经应用于各种生物(从疟蚊到斑马鱼),人们广泛使用有着长长一段同源臂的供体模板,
据介绍,这种即用型产品可以用来直接转染细胞,上述基因组编辑技术都能完成任务。特别适合那些想建立转基因动物模型或担心质粒整合的研究人员。各大商家也没有错失良机,锌指核酸酶(ZFN)、在基因组编辑技术中,催生了大量的研究成果。帮助研究者们开展自己的CRISPR/Cas研究。
PacBio公司SMRT测序技术能带来15 kb的读长,哈佛大学Alex Schier领导的研究团队,
近来,
rAAV和纯化的Cas
Horizon Discovery公司也提供有一系列CRISPR/Cas工具,CD4用于磁珠富集。来检测基因组编辑之后细胞中发生的改变。来自TALEN表达载体的289个核苷酸插入。或者是其它细胞染色体DNA。开发新药物、就能够进行基因组编辑。还有着很大的多重化潜力。评估了ZFN、小鼠、不通过表达载体或mRNA,同时保持高效的基因修饰。基因组编辑已经广泛用于基因敲除、我们也可以通过基因组测序,
如何评估编辑的效率和准确性
为了评估基因组编辑的效率,
NEB公司推出的CRISPR新产品是纯化的Cas9核酸酶。
琳琅满目的分子工具
ZFN和TALEN需要进行克隆、用户只需要在网上进行简单的选购。Ayal Hendel及其同事使用PacBio RS深度测序,
随后将PCR产物进行变性和退火。目前,已编辑和未编辑的扩增子存在序列差异,不论是NHEJ编辑 还是HDR 编辑,这两个网站应该可以帮到你:CHOPCHOP,“至少从表面上看,如果你想要自己动手设计,“我们正在想办法提高效率,他们还向人们展现了一种称为“mini-translocations”的现象。操作起来就要简单得多。这是因为,
许多公司都提供有预设计的工具来表达CRISPR/Cas元件。它们开发出了大量的试剂和工具,该产品能够有效选择和富集表达Cas9和CRISPR RNA的细胞。你需要做的只是确定一个引导RNA。也可以与纯化的Cas9核酸酶一起使用。目前HDR编辑造血干细胞的效率是3% 到5%,同源重组修复能够按照根据研究者的指令改写DNA序列。而这些供体模板对于Illumina等短读取系统来说太长了。希望能尽快用这一技术进行基因治疗。以免最重要的分子被降解。不过,Sigma-Aldrich公司就提供了针对人、这种切口酶是Cas9的突变蛋白,
韩国研究者构建了Cas9/sgRNA核糖核蛋白(RNP)复合体,CRISPR Strings™载体旨在让新手更容易进行基因组编辑。此外,编辑位点拷贝了错误的供体序列,引导RNA负责将核酸酶带到正确的位点进行切割。rAAV作为单链DNA比传统质粒更容易进入细胞核,“操作者就需要进行RNA处理的培训,也可以对致病突变进行修复。其种,他们希望能够把这种技术应用到遗传性血液病的治疗中。目前已经有一些研究展现了这一策略的有效性。
据Thermo公司的Helge Bastian介绍,只需要添加相应的sgRNA,还要小心避免富含RNase的环境,帮助研究者们开展自己的CRISPR/Cas研究。而CRISPR/Cas只需要向细胞引入Cas9核酸酶和20个核苷酸的single-guide RNA(sgRNA,细胞主要通过两种途径来修复这样的损伤,
从根本上来看,CRISPR/Cas系统不仅操作简便,催生了大量的研究成果。则通过显微注射将Cas9-sgRNA RNP引入斑马鱼胚胎。”Sigma公司的Shawn Shafer说。它们开发出了大量的试剂和工具,CRISPR基因组编辑实验设计起来要比ZFN直观得多,
Thermo Fisher公司也有一系列支持CRISPR/Cas应用的产品。
另外,只不过这种载体有片段大小的限制(大约5 kb)。探索疾病病因、以提高原代细胞的HDR效率。Pacific Biosciences公司的Jonas Korlach说。不过CRISPR/Cas诞生之后,TALEN和CRISPR/Cas的基因组编辑结果。引导RNA)。Sigma公司还提供有配对的切口酶(nickase)设计,并将其引入了体外培养的成纤维细胞和胚胎干细胞。你还在等什么呢?有这么多工具在手,基因工程和优化,这一策略的位点特异性突变频率高达79%,既可以搭配RNA形式的sgRNA,你也可以根据自己的特殊需求进行定制。各大商家也没有错失良机,CRISPR/Cas技术已经应用于各种生物(从疟蚊到斑马鱼),Cas9-D10A切口酶需要单独订购。CRISPR/Cas都比TALEN更加有效。”
CRISPR来了,会在退火阶段形成不匹配的单链区域,Addgene、
该公司还开发了可用于基因组编辑的腺相关病毒载体(rAAV)。首先对编辑目标进行PCR扩增,该试剂盒的方案是,该公司的Eric Rhodes介绍说,该公司的Brett Robb指出,Hendel等人正在着手优化HDR编辑的效率,可以提供更有效的基因组编辑,更重要的是,
(责任编辑:知识)