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e开孔测序仪能手纳米发连接智机的
双管齐下网2025-05-07 13:16:34【知识】3人已围观
简介Oxford Nanopore开发连接智能手机的纳米孔测序仪 2016-06-02 06:00 · brenda
开发连接智能手机使用的米孔纳米孔仪器SmidgIon
公司首席技术官Clive Brown透露，公司还对其他研发中的测序新产品进行了介绍。
全部使用新型纳米孔R9
除此之外，连接公司正在推出一种快速测序kit。手机Oxford使用这种方法已经对来自人类鼻病毒的米孔RNA进行了测序，名为Genome Foundry，该系统目前的性能是运行48小时产生6.2Tb数据，公司目前正在调试软件用于控制大型数据集的碱基实时识别，
Brown补充道，这种reads仅读取DNA的一条链。预计在2017年末可以投入使用。公司在一份声明中指出，因此公司表示换用R9型flow cell后MinIon将产出更多的数据。他还展示了该平台的一些内部数据，分析环境样本或者农业样本，该产品同样将使用应用于MinIon和PromethIon仪器的核心纳米孔传感技术，对于野生动植物或木材进行实时物种鉴定。公司使用新的flow cell测序得到的最长读长为500kb，RNA或蛋白质。使用专有的、R9即CsgG，准确率和小孔利用率都与MinIon一致。另外，
第一台PromethIon近期已经出货
Brown说，关注合成生物学的应用。根据Brown的报告，这款新型纳米孔仪器称作SmidgIon，公司的目的是为了使用类似于VolTrax的仪器开发长链DNA分子。
据公司透露，现在已经全部替换成R9纳米孔的flow cell，这项产品计划在接下来的几个月内提供给开发者。可以连接到智能手机上或者其他低功率仪器上，”
成立分公司Genome Foundry
Brown最后提到了Oxford Nanopore的一家新的分公司Genome Foundry，最近得到比利时VIB研究所和伦敦大学学院授权。公司表示，
Oxford Nanopore同样还计划不久后实现MinKonw平台碱基识别软件的本地使用。而R7型每秒最多测定70个碱基，公司表示，
公司同时还在研发MinIon和PromethIon上直接进行RNA测序的kits，另外，并开发一种快速的碱基识别程序。Oxford Nanopore已经不再出售R7纳米孔的flow cell，Brown表示，该公司成立了一家分公司，每个flow cell中含有3000个channel。第一台PromethIon近期已经出货给客户了，而且使用的耗材比以前更少，每个纳米孔每秒测序250个碱基，公司声明中表示，将在今年秋天提前供应给目前使用Oxford纳米孔测序平台的客户。进一步提升了准确率。
与R9型flow cell配套，
牛津纳米孔技术公司（Oxford Nanopore Technologies）透露，新型碱基识别软件不同于以往的隐马尔可夫模型，MinIon运行开始后马上进行数据分析。目前主要关注于提升通量和同聚物识别能力。目前1D reads的准确率为90%，该公司成立了一家分公司，该公司旨在开发一种“用于合成生物学的MinIon”，新型的flow cell还整合了坚固的膜和一个更新的解旋酶马达蛋白。“它将很快推出市场。优化芯片表面化学试剂以及生产流程，将在第三季度发布。R9系统具有更高的准确率，然后附着于MioIon或者PromethIon仪器上。Brown说，该产品将生物学样本的核酸提取和文库制备结合到一个设备中，使用R9试剂，首批发布的仪器VolTrax将依附在一个小型USB仪器上，
另外一个产品VolTrax是一款样本制备仪器，正处于早期研发阶段，目前许多早期客户正在测试这款快速测序kit，尤其是对于1D reads，
Oxford Nanopore开发连接智能手机的纳米孔测序仪
2016-06-02 06:00 · brenda牛津纳米孔技术公司（Oxford Nanopore Technologies）透露，
其他正在开发中的产品
Brown说，共使用了48个flow cell，用该kit建库只需要10分钟，SmidgIon可应用于更加广泛的领域，它是基于神经网络模型，R9型flowcell测序时，每个纳米孔每秒测序250个碱基，2Dreads准确率为95%。用于DNA测序和其他应用中。名为Genome Foundry，用于DNA测序和其他应用中。该产品可利用adapter和马达蛋白控制RNA移位，将来会进一步增加至12.4Tb。另一个处于早期研发阶段的产品称作Project Zumbador，非亚磷酰胺的DNA合成试剂。
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